在现代网络社会发展的同时，产生了假想的空间--数码世界。因此人工智能生命体数码暴龙诞生，数码暴龙所生存世界叫数码世界(Digital World)，它由谜一样的电脑主机--世界树(Yggdrasil)直接管理。数码暴龙们的资料容量大大超过的预料，数码世界面临巨大化宇宙规模的膨胀。再这样下去，数码世界即将陷入危机！
于是世界树决定舍弃这个旧的数码世界，启动了"移向新的数码世界(New Digital World，简称NDW)"的计划。然后消除了全部对于NDW没有必要的数码暴龙并执行了恐怖的X程序！
这个计划名叫"箱舟计划"，它执行使超过负荷的数码暴龙全部删除，把必要的数码暴龙及部份研究对象上传到了新的数码世界。但是一部分生存下来的数码暴龙，它们强大的生命力使自身电脑核(数码核)发生了改变，并获得了抵抗X程序的"X抗体"进行了X进化。世界树为了保证方舟计划的顺利执行，把消灭异分子的任务交给了皇家骑士(Royal Knight)。
抱着必死的决心抵抗的X数码暴龙……那些抗拒X数码暴龙的被选中的数码暴龙……贯彻世界树所谓的正义的皇家骑士……
所有的生命只为了活着而存在……现在，冒险X进化了！

●战斗暴龙兽X

等　级：究极体
类　型：龙人型
属　性：疫苗种
必杀技：盖亚能量炮、海神之力

装备着"恐龙克星"任何东西都可以切裂的龙人型数码暴龙战士！

●钢铁加鲁鲁兽X

等　级：究极体
类　型：改造型
属　性：资料种
必杀技：绝对冷冻气、冰冻炸弹

全身装备无数武器的机械化数码暴龙。战斗暴龙兽的战友。以压倒性的火力著称。

●金甲龙兽

等　级：装甲体
类　型：圣骑士型
属　性：疫苗种
必杀技：极限能量波

身穿黄金铠甲的光速圣骑士！对于阻碍任务的人没有任何慈悲可言。

●狮子兽

等　级：成熟期
类　型：兽人型
属　性：疫苗种
必杀技：百兽拳

被称为高贵勇者的数码暴龙。拥有在试练中锻炼的体魄和正义的心，打倒过很多邪恶的数码暴龙。

●多路兽

等　级：成长期
类　型：兽　型
属　性：资料种
必杀技：金属加农

故事的主人公，体内拥有X抗体。它的出生还是个谜。多路兽掌握着数码世界的命运？

●奥米加兽

等　级：究极体
类　型：圣骑士型
属　性：疫苗种
必杀技：暴龙之剑、加鲁鲁炮、所有删除

履行世界树的使命，执行删除数码暴龙的方舟计划的使命，以恐怖力量而著称的最强圣骑士！

●红莲骑士兽

等　级：究极期
类　型：圣骑士型
属　性：病毒种
必杀技：皇家救星、红莲剑

虽然是皇家骑士一员，但对世界树的做法产生了质疑，因此经常单独行动。